将合成生物学与AI相结合，以无细胞方式寻找新抗生素

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原标题：将合成生物学与AI相结合，以无细胞方式寻找新抗生素

关键字：报告,活性,深度,蛋白质,序列

文章来源：人工智能学家

内容字数：7510字

内容摘要：将 ScienceAI设为星标第一时间掌握新鲜的 AI for Science 资讯编辑 | 萝卜皮生物活性肽是健康和医学的关键分子。深度学习为生物活性肽的发现和设计带来了巨大的希望。然而，需要合适的实验方法来以高通量和低成本验证候选物。马克斯·普朗克陆地微生物研究所（Max Planck Institute for Terrestrial Microbiology）的研究团队建立了无细胞蛋白质合成（CFPS）管线，用于直接从 DNA 模板快速、廉价地生产抗菌肽 (AMP)。为了验证该平台，研究人员使用深度学习从头设计了数千个 AMP。使用计算方法，研究人员对使用 CFPS 管线生成和筛选的 500 个候选物进行了优先排序。该团队鉴定了 30 种功能性 AMP，并通过分子动力学模拟、抗菌活性和毒性对其进行了进一步表征。值得注意的是，六种 de novo-AMP 具有针对多重耐药病原体的广谱…

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