打破AlphaFold大模型局限，世界最大蛋白质相互作用数据集AlphaSeq横空出世

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原标题：打破AlphaFold大模型局限，世界最大蛋白质相互作用数据集AlphaSeq横空出世
关键字：蛋白质,细胞,数据,酵母,模型
文章来源：新智元
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新智元报道编辑：乔杨
【新智元导读】虽然AlphaFold等系列的大模型已经在蛋白质预测方面取得了前所未有的突破，但依旧无法胜任蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）这种复杂的任务。初创公司A-Alpha Bio的PPI数据集AlphaSeq，有望补足这方面的技术短板。随着最近AlphaFold 3和ESM 3的相继推出，我们看到了深度学习在生物学领域的无限潜力。
然而，Dyno Therapeutics的高级机器学习工程师Abihishaike Mahajan在上个月发布的一篇博文中指出了潜在的增长危机。
他认为，AlphaFold系列所取得的成果，即将一个强大的深度学习模型应用于一个已经存在大量数据的领域，从而引发一场彻底的革命——这是极难复制的。
原因还是数据。我们几乎用尽了所有预先存在的数据，未经训练的蛋白质结构和序列正在枯竭，RNA和DNA也是如此。
要想进一步训练模型，发掘更多来源和模态的数据是必不可少的。Mahajan指出，理想情况下，这样的数据应该满足3个条件：
– 具有复杂的潜在分布
– 与重要的生理现象高度相关
– 适合大规模收集
在生物学领域，有很多数据可以满足前两个

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