AI助力RNA病毒研究历史性突破,中山大学等用深度学习模型,发现超过16万种新病毒

AI助力RNA病毒研究历史性突破,中山大学等用深度学习模型,发现超过16万种新病毒

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原标题:AI助力RNA病毒研究历史性突破,中山大学等用深度学习模型,发现超过16万种新病毒
关键字:病毒,基因组,序列,多样性,解读
文章来源:HyperAI超神经
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作者:田小幺
编辑:李宝珠
中山大学医学院的施莽教授联合浙江大学、复旦大学、中国农业大学、香港城市大学、广州大学、悉尼大学、阿里云飞天实验室等,提出了全新的深度学习模型 LucaProt,基于 Transformer 框架与大模型表征技术,结合蛋白质序列和内在结构性特征,在独立的测试数据集上表现优异。2020 年初,新冠病毒的阴影迅速笼罩全球。在这场与时间的赛跑中,我们见证了无数英勇的个体和团队挺身而出,社会体系经历了一次次严峻考验,也为全球的公共卫生领域敲响了警钟。
冠状病毒之所以令人畏惧,很大程度上是因为它属于 RNA 病毒。这类病毒在复制过程中缺乏纠错机制,容易发生突变。这种突变能力不仅允许 RNA 病毒跨物种传播,扩大宿主范围,还可能引发致病力的变化。原本对人类无害的病毒,一旦发生突变,就可能变得具有致病性,从而引发疾病。由于人类对这类突变病毒普遍缺乏免疫力,一旦病毒发生变异,就可能迅速引发大规模的疾病流行。
尽管病毒与人类健康密切相关,但人类已知已确认的病毒种类仅有 5,000 余种,可谓是冰山一角。传统 RNA 病毒鉴定方法高度依赖序列同源性比对,即通过比较未知病毒与已知病


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