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BioRxiv,论文预印本网站,影响因子,期刊,怎么引用
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BioRxiv官网,影响因子,期刊,怎么引用,论文预印本网站

BioRxiv简介

《BioRxiv》是美国的一个非营利组织Cold Spring Harbor Laboratory于2013年创建的学术论文存储和发布平台,也被称为预印本在线期刊。预印本是指科研人员在正式出版之前,自愿将研究成果发布在学术会议或互联网上,以便进行同行交流。与传统在线学术期刊相比,预印本具有类似的特点,如公开发表、标准格式和自动获取等,但最显著的区别是无需同行评审。
BioRxiv官网: https://www.biorxiv.org/

BioRxiv怎么样?

由于无需同行评审,投稿至《BioRxiv》的周期较短,只需通过基本筛查,如非剽窃抄袭、科学性和非攻击性等即可发表。严格来说,《BioRxiv》并非一本杂志,因此没有影响因子。

优势

《BioRxiv》相对于传统期刊的优势有哪些?
为何要将手稿投至《BioRxiv》?首先,可以尽早发表研究成果,避免同行较早发表相似研究成果而打乱发表计划。《BioRxiv》具有高效的时间管理,48小时内即可显示,作为先后顺序的证据。其次,《BioRxiv》发表论文是免费的。此外,与传统论文一样,可通过DOI和PMID进行检索和引用。自《BioRxiv》成立以来,越来越多的医学期刊加入合作,包括《科学》、《自然》和《柳叶刀》等。预计未来将有更多期刊与《BioRxiv》合作。
手稿可在提交其他期刊之前或评审阶段发布在《BioRxiv》上,但如果已被其他期刊接受,则不应再发表于《BioRxiv》上。在正式接受文章之前,作者可随时提交修订版本。一旦手稿提交至《BioRxiv》,作者可收到同行的反馈意见。
当然,第一时间将研究成果发布至《BioRxiv》也存在缺点,若后续投稿不顺利,很容易被他人的最新成果覆盖甚至抄袭。
因此,是否使用《BioRxiv》发布文章需要作者自行权衡利弊。然而,个人认为基础研究周期较长,很少存在被抄袭的情况。而且,对学术不端行为进行了严格查处,一旦确认,相关科研人员将承受巨大的代价。
在生物学领域,文章即你的通行证。然而,文章的发表是一个耗时耗力耗心血的过程,从投稿—送审—收到修改意见—修回—接收,少说也得有3-5个月,这还是在一次性成功的情况下。更常见的是多次修回的,拒稿重投的,耗上个一年半载甚至数年也是常事(Nature论文修回的时间不限,修个两三年也是很常见的事情)。当你急需文章需要毕业或者申请职位或基金时,一个不需要同行评审的预印本发行和存储服务—BioRxiv(发音为bio-archive)或许能帮助你,并且该服务是免费的

BioRxiv测评

首先简单介绍一下BioRxiv: 它由非营利的研究和教育机构冷泉港实验室在2013年发起并运维,将其作为一种促进学术交流的方法,目前只接收英文手稿。由于不需要同行评审,所以耗时短。只要你的文章通过了攻击性和/或非科学性、剽窃抄袭等基本筛查即可发表。BioRxiv不是杂志,所以没有影响因子。当你将手稿提交到BioRxiv后,你可以收到同行的反馈意见。手稿可以在提交杂志之前或杂志评审阶段发布在BioRxiv上,但如果已被杂志接收,则不应发布。在期刊正式接受文章之前,作者可以随时通过点击作者区域内的“提交修订”来提交文章的修订版本。一旦发布到biorxiv上,文章就可以引用,因此无法删除。
BioRxiv有如下几点优势:1)可以尽早地公开自己的发现,当你的手稿在线发表在BioRxiv后,BioRxiv会显示发表时间,这可以避免以下尴尬:在这漫长的投稿-发表过程中,你的竞争者捷足先登,在杂志上发表了和你类似的发现,这可能会打乱你原来的发表计划,转投其他杂志,或者再补充新的数据超越前者。而BioRxiv因为其时效快,48小时内即可显示,可以作为先后顺序的证据,或引导你和竞争者背靠背发表。2)发表在BioRxiv上的文章也可以作为申请基金或者岗位的筹码,大多数研究资助者开始将预印本“合法化”。目前,英国医学研究理事会、NIH以及霍华德·休斯医学研究所都鼓励受资助者在基金申请书中引用预印本,而不只是经过同行评议的论文。陈和扎克伯格基金会(CZI)甚至要求受资助者在论文被提交给期刊的同时发表预印本。
作为当下生物领域最大的预印本发行服务,BioRxiv的流行度如何呢?哪个专业的文章发表最多呢?发表在BioRxiv上的文章最终发表在哪些杂志上了?这些文章的引用率和下载量如何呢?明尼苏达大学的Ran Blekhman 和Richard J.Abdill就这些问题对2013-2018年11月的37,648篇文章进行了数据分析,他们发现发表在BioRxiv的文章量呈逐年逐月递增趋势(图1a),下载量也成递增趋势(图1b),同时选择发表在BioRxiv的作者数目也在增加(图1c)。其中2018年投稿数目为18,825,比之前四年的总合还多,这里面神经科学和生物信息学方向的文章数目和比重最高,分占一二席。单2018年10月就有2,000投稿量。下载量方面,单篇文章的下载量中位数是279,其中基因组学的单篇下载量中位数最高,为496,但由于神经科学文章量最多,使其在下载总量方面于2018年10月首次超过生物信息学。目前已有十万六千多作者在BioRxiv上投稿,2018年新增了84,000作者。这些数据都显示 BioRxiv越来越被认可。 
 

图1.BioRxiv的累积投稿量、下载量及投稿作者数目。a)投稿量的整体趋势。b) 总下载量的整体趋势。c)每年向BioRxiv投稿的新增作者数及总作者数。
那么这些预印本手稿的发表情况如何呢?如果手稿已发表在杂志上,BioRxiv网站会在文章题目下方给出手稿发表杂志的链接,参照这一数据,迄今为止已有42%的文章被发表。其中进化生物学发表率最高,神经科学发表数目最多(图2)。不过这一统计结果有个小问题,因为有些预印本在发表过程中改变了名称,所以实际上这一数据更高,并且2017年以前上传的预印本发表率基本上在60%以上, 2018年的发表率约为20%,拉低了平均水平,但也可以理解,毕竟2018年新上传的手稿需要足够时间发表。

 图2. 不同专业领域预印本发表的比例(b)和数目(c)
另一个大家比较关注的问题是:预印本都去哪儿了?发表在什么杂志上了呢?数据显示这些文章最终发表在1,531种不同杂志上,其中Scientific Reports 发表了最多(828),其次是elife(750)和PLOS ONE(741)(图3)。虽然数目不多,还是有预印本发在高影响因子杂志上,如:至2018年11月,已有35篇文章发表在Cell。那么这些文章的发表周期如何呢?作者统计了从预印本上传日期和杂志发表日期的时间间隔,发现发表周期中位数是5.5个月,75%的杂志能在8个月内发表,90%的杂志能在一年内发表,而最长记录是三年七个月。Nature Genetics的中位发表周期最长,约9个月;G3杂志最短,约4个月。
 

图3.预印本的杂志发表情况:发表在Scientific Reports、elife、PLOS One杂志上的预印本数目最多
预印本的下载量可以表征该预印本的受关注程度。作者结合杂志影响因子和预印本下载量发现,高下载量的文章通常也发表在高影响因子杂志上,具有较高的正相关性(图4)。发表在Nature MethodsNature Genetics杂志上的预印本单篇下载量最高,而PLOS ONE上单篇下载量最低.

图4.发表在不同杂志上的预印本的单篇文章下载量。中间框显示杂志影响因子与其预印本中位下载量的关系。
怎么样?是否也打算将你未发表的手稿先发布在bioRxiv预印本上呢?

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