南开&山大&北理工团队开发trRosettaRNA：利用Transformer网络自动预测RNA 3D结构

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原标题：南开&山大&北理工团队开发trRosettaRNA：利用Transformer网络自动预测RNA 3D结构

关键字：结构,方法,深度,基准,蛋白质

文章来源：机器之心

内容字数：6624字

内容摘要：将 ScienceAI设为星标第一时间掌握新鲜的 AI for Science 资讯编辑 | 萝卜皮RNA 3D 结构预测是一个长期存在的挑战。受最近蛋白质结构预测领域突破的启发，南开大学、山东大学以及北京理工大学的研究团队开发了 trRosettaRNA，这是一种基于深度学习的自动化 RNA 3D 结构预测方法。trRosettaRNA 流程包括两个主要步骤：通过transformer网络进行 1D 和 2D 几何形状预测；以及通过能量最小化进行的 3D 结构折叠。基准测试表明 trRosettaRNA 优于传统的自动化方法。在 CASP15 和 RNA-Puzzles 实验的盲测中，对天然 RNA 的自动 trRosettaRNA 预测与人类的顶级预测具有竞争力。当通过均方根偏差的 Z 分数进行测量时，trRosettaRNA 的性能也优于 CASP15 中其他基于深度学习的方法。该研…

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