AlphaFold 3轻松应对核酸、脂类分子?科学家迫不及待地更新了评测

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原标题:AlphaFold 3轻松应对核酸、脂类分子?科学家迫不及待地更新了评测
关键字:序列,回文,转录,限制性,结构
文章来源:机器之心
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「如果这可以重现的话,这就是我们所知的世界末日!功能建模的新时代已经开始。」欧洲分子生物学实验室(EMBL)的科学家 Jan Kosinski 发推文表示。他在 AlphaFold 3 发布后,立刻用它做了一系列简单的测试,并把相关结果发在了 X 上。
「我取出了一个结构未知的转录因子,将其折叠起来,将其识别序列嵌入更长的 DNA 中。AlphaFold 3 准确定位了转录因子。」Kosinski 解释道。
他使用的转录因子:https://jaspar2020.genereg.net/matrix/MA0027.2/
使用的 DNA 序列:CAGGATCCTAATTATGGATCCTGTGTATCTTCAGT
他用的模型是:https://oc.embl.de/index.php/s/SsDKcS06P1xewAV
他说:「一旦 AlphaFold 3 的开源副本可用并且运行良好,我们也许能够通过计算来预测所有转录因子的序列特异性。我认为那会很大,对吧?」
同时,严谨的 Kosi


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