命中率达60%,AlphaFold预测受体的三维结构,加速药物开发

命中率达60%,AlphaFold预测受体的三维结构,加速药物开发

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原标题:命中率达60%,AlphaFold预测受体的三维结构,加速药物开发
关键字:报告,结构,激动剂,模型,化合物
文章来源:人工智能学家
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来源:ScienceAI
编辑:白菜叶
人工智能正在彻底改变蛋白质结构预测,为药物设计提供前所未有的机遇。
为了评估对配体发现的潜在影响,瑞典乌普萨拉大学(Uppsala University)和瑞典卡罗林斯卡学院(Karolinska Institute)的研究人员利用人工智能创建了一种受体的未知三维结构模型。
在这个模型中,TAAR1 受体是一种重要的靶蛋白,可用于开发治疗精神疾病的药物。激活 TAAR1 的药物分子在治疗精神分裂症和抑郁症方面显示出良好的效果。
该团队比较了使用 AlphaFold 机器学习方法生成的蛋白质结构和传统同源性建模的虚拟筛选。
研究人员用超过 1600 万种化合物对接到 TAAR1 模型上,分别从 AlphaFold 和同源性模型筛选中筛选出 30 和 32 种排名靠前的化合物。其中 25 种是 TAAR1 激动剂,药效范围为 12 至 0.03 μM。
AlphaFold 筛选的命中率(60%)比同源模型高出两倍多,并且发现了最有效的激动剂。
其中一种具有良好选择性和类药物特性的 TAAR1 激动剂,在野生型小鼠中表现出生理和抗精神病作用。
该研究以


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