灵敏度提高56%,港中文/复旦/耶鲁等联袂提出全新蛋白质同源物检测方法
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原标题:灵敏度提高56%,港中文/复旦/耶鲁等联袂提出全新蛋白质同源物检测方法
关键字:蛋白质,序列,结构,解读,方法
文章来源:HyperAI超神经
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作者:田小幺
编辑:十九,李宝珠
基于蛋白质语言模型和密集检索技术,香港中文大学李煜,联合复旦大学智能复杂体系实验室、上海人工智能实验室青年研究员孙思琦、耶鲁大学 Mark Gerstein 提出了一种超快速、高灵敏度的同源物检测框架——密集同源物检索器。蛋白质是构成生命的物质基础,是生命活动的主要承担者。在后基因组时代,随着蛋白质测定技术的发展,蛋白质序列数据库规模呈爆炸式增长。为了深入了解蛋白质的多样性和功能,识别蛋白质在生物学中也就显得尤为重要。
在对蛋白质的识别过程中,蛋白质序列的同源性鉴定则是其中一项至关重要的任务,它能够帮助科学家们理解蛋白质的进化关系、结构特征以及功能。传统的蛋白质序列比对方法虽然在许多情况下表现出色,但在面对远端同源物时显得力不从心。这些远端同源物由于序列相似性较低,在常规比对中往往被忽视,从而限制了研究人员对蛋白质多样性和复杂性的全面认识。
为解决蛋白质远同源性研究的痛点,基于蛋白质语言模型和密集检索技术 (dense retrieval),香港中文大学李煜,联合复旦大学智能复杂体系实验室、上海人工智能实验室青年研究员孙思琦、耶鲁大学 Mark Ger
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