入选NeurIPS 2024！西湖大学提出通用分子逆折叠模型UniIF，对AlphaFold 3形成进一步补充

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原标题：入选NeurIPS 2024！西湖大学提出通用分子逆折叠模型UniIF，对AlphaFold 3形成进一步补充
关键字：分子,模型,结构,研究人员,蛋白质
文章来源：HyperAI超神经
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作者：梅菜
编辑：十九
来自西湖大学未来产业研究中心的团队提出了一个统一模型 UniIF，用于所有分子的逆折叠。实验结果表明，UniIF 在在蛋白质设计、RNA 设计和材料设计等多个任务上都达到了最先进的性能。分子逆折叠在药物和材料设计中起到关键作用，使得科学家能够合成具有理想结构的新分子。过去的研究大多集中于大分子或小分子的逆折叠，但却很少关注通用分子的逆折叠。
构建统一的通用模型主要存在 3 大挑战：① 单位差异：大分子一般将预定义的微结构作为基本单元，如氨基酸之于蛋白质，核苷酸之于 RNA；而小分子将原子作为基本单元；② 几何特征提取：不同研究在几何特征提取方面采用多种策略，如距离、角度和张量积，缺乏统一的特征化方法；③ 系统规模：小分子允许全局注意力机制来学习长期依赖关系，但这往往在大分子上行不通。
为了解决上述挑战，并进一步补充 RoseTTAFold All-Atom 和 AlphaFold 3 在分子结构预测上取得的进展，来自西湖大学未来产业研究中心的团队提出了一个统一模型 UniIF，用于所有分子的逆折叠。研究人员在蛋白质设计、RNA 设计和材料设计等多个任务上进行了全

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