轻松上手分子动力学模拟器LAMMPS：npt控温估计FCC Cu熔点

无需安装软件，CPU 即可运行

原标题：轻松上手分子动力学模拟器LAMMPS：npt控温估计FCC Cu熔点
文章来源：HyperAI超神经
内容字数：2672字

HyperAI超神经官网推出LAMMPS入门教程

HyperAI超神经官网的教程板块上线了新的LAMMPS入门教程：「LAMMPS入门教程：npt控温估计FCC Cu熔点」。该教程旨在帮助用户快速上手LAMMPS，一款功能强大的分子动力学模拟软件。

LAMMPS软件介绍

1. LAMMPS (Large-scale Atomic/Molecular Massively Parallel Simulator)是由美国Sandia国家实验室开发的开源软件，自2004年发布以来，在材料建模领域得到了广泛应用。

2. 它可用于模拟多种材料，包括固态材料（金属、半导体）、生物分子和聚合物等，并提供多种粒子相互作用模型。

3. LAMMPS支持单处理器和并行运行，代码设计易于修改和扩展，并在CPU、GPU和Intel Xeon Phis上提供加速性能。

4. 从2004年的5万行代码发展到2022年的100万行代码，展现了其持续的改进和功能扩展。

教程内容及运行步骤

1. **教程目标:** 理解npt控温操作流程，学习使用dump和fix指令进行数据预处理。

2. **在线运行:** 用户可在HyperAI超神经官网教程页面找到该教程，并点击“在线运行此教程”进行体验。需要注册HyperAI账号，新用户可使用提供的邀请链接获取免费时长。

3. **运行环境:** 教程使用CPU版本的LAMMPS，并提供NVIDIA RTX 4090算力选择（需付费）。

4. **运行步骤:** 克隆教程到个人容器，选择算力及付费方式，等待资源分配。进入工作空间后，解压提供的压缩包`melt_u3.zip`，包含预设的LAMMPS输入文件。在终端运行命令`mpirun -np 2 lmp < melt.in | tee out`运行模拟（约5-10分钟）。

数据处理与可视化

1. **数据获取:** 模拟完成后，`t_v.txt`文件包含温度体积数据，`md.lammpstrj`文件包含原子轨迹数据。

2. **软件安装:** 教程指导用户使用`apt-get`更新apt源并安装`gnuplot`绘图工具。

3. **结果可视化:** 运行`gnuplot p.plt`脚本生成温度-体积曲线图，确定熔点（约1600K）。

4. **原子轨迹可视化:** 将`md.lammpstrj`文件下载到本地，使用OVITO软件打开并播放，观察铜原子溶解过程。

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