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原标题:AlphaFold 预测细菌生存所需的 1402 种蛋白互作,最完整的细菌必需相互作用图谱
关键字:蛋白质,细菌,研究人员,复合物,结构
文章来源:人工智能学家
内容字数:5115字
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新鲜的 AI for Science 资讯革兰氏阴性必需相互作用组。(来源:eLife)
编辑 | 紫罗
细菌蛋白质组平均由约 4000-5000 个蛋白质组成,这意味着相互作用组可能多达 2000 万个相互作用。
据估计,大肠杆菌中大约有 12,000 种物理相互作用。然而,并非所有这些相互作用都对细菌的生存至关重要。
对生物体中蛋白质相互作用的研究,是理解生物过程和中心代谢途径的基础。然而,我们对细菌相互作用组的了解仍然有限。
近日,西班牙巴塞罗那自治大学(Universitat Autònoma de Barcelona,UAB)的研究人员使用人工智能工具 AlphaFold,预测并模拟了细菌中必需(essential)蛋白质之间的 1402 种相互作用。
研究人员绘制了最完整的细菌必需相互作用图谱,即蛋白质如何结合和相互作用以执行其生存所必需的功能。
这些结果揭示了这些机制以前未知的细节,并为开发新的抗生素提供了潜在的靶点。
该研究以《Structural assembly of the bacterial essential in
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