中科院罗小舟团队提出 UniKP 框架,大模型 + 机器学习高精度预测酶动力学参数

中科院罗小舟团队提出 UniKP 框架,大模型 + 机器学习高精度预测酶动力学参数

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原标题:中科院罗小舟团队提出 UniKP 框架,大模型 + 机器学习高精度预测酶动力学参数
关键字:数据,模型,动力学,表示,向量
文章来源:HyperAI超神经
内容字数:7497字

内容摘要:


作者:李宝珠
编辑:三羊
中国科学院深圳先进技术研究院罗小舟团队提出了,基于酶动力学参数预测框架 (UniKP),实现多种不同的酶动力学参数的预测。众所周知,生物体内的新陈代谢是通过各种各样的化学反应来实现的。这些反应如果在体外进行,通常需要在高温、高压、强酸、强碱等剧烈条件下才能发生。
但在生物体内,新陈代谢反应却可以在极为温和的条件下高效进行,这主要归功于重要的有机催化剂——酶。
作为贯穿高中生物学科的高分知识点,酶的特性或许已经烙印在大家记忆深处——催化效率高、专一性强、作用条件温和等。更重要的是,酶与很多人体疾病密切相关,还可以用于诊断与治疗。一直以来,人们在深入研究酶分子结构与功能的同时,也在持续探究酶促反应的影响因素。
研究酶促反应速率以及各种因素对酶促反应速率影响机制的科学,被称为「酶促反应动力学」,在研究中,酶在特定反应中的催化效率通常通过酶动力学参数 (enzyme kinetic parameters) 来衡量。
酶促反应动力学参数包括了酶周转数 kcat、米氏常数 Km 和催化效率 kcat / Km 等,目前主要依赖湿实验来进行参数测量,但这一过程耗时且成本高,


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