Nature重磅研究：AlphaFold绘制病毒「族谱」，揭开身世之谜

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原标题：Nature重磅研究：AlphaFold绘制病毒「族谱」，揭开身世之谜
关键字：病毒,蛋白质,模型,结构,蛋白
文章来源：新智元
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新智元报道编辑：乔杨 好困
【新智元导读】除了蛋白质设计和药物发现，Nature上最近刊登的一篇论文又解锁了AlphaFold这类生物大模型的新用途——揭示生物的亲缘关系和进化史。今年7月，被Meta解散的ESMFold团队成功另起炉灶，发布了他们最新的生命科学大模型ESM3，打出的slogan正是「用语言模型模拟5亿年进化。」
论文地址：https://evolutionaryscale-public.s3.us-east-2.amazonaws.com/research/esm3.pdf
这个用途，很快就被生物学家们敏锐地捕捉到了。
最近发表的很多工作中，科学家们正在用AlphaFold和ESMFold等模型，重新绘制病毒谱系，探索到了一些令人惊讶的「亲缘关系」。
这些成果，不仅可以揭秘病毒家族的进化史，还能让我们更好地应对未来的生化风险。
如果用传统方法，科学家们需要根据基因组比较的结果来理解病毒进化。
但是和哺乳动物比起来，病毒的进化速度可以说是快如闪电，尤其是基因由RNA组成的病毒，需要比对的基因组数量和复杂度就会急遽增加。
此外，病毒的进化不仅来源于基因突变，它们还可以从

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